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基于酶切的簡化基因組測序

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基于酶切的簡化基因組測序

產品描述信息

      RADRestriction-site Associated DNA)是與限制性核酸內切酶識別位點相關的DNA。基于酶切的簡化基因組測序(RAD-Seq)對酶切獲得的RAD tag進行高通量測序,大幅降低基因組的復雜度,操作簡便,同時不受參考基因組的限制,可快速鑒定出高密度的SNP位點。RAD-Seq基于SNP位點的分子標記技術,性價比高、穩定性好,可用于群體進化研究、遺傳圖譜構建、QTL定位和輔助 scaffold組裝到染色體等領域。

產品詳細信息

 

1、高密度、高覆蓋度:獲得貫穿整個基因組的高密度分子標記;

2、精確度高:采用DISR生物信息分析流程,保證SNP的高準確性;

3、性價比高:基于酶切簡化的基因組DNA,數據量低,特別適合大樣本量研究;

4、快速高效:只需3-4個月即可完成大樣本的圖譜構建或群體進化研究。

1、樣品類型:DNA樣品;

2、樣品總量(單次):小片段文庫,≥ 3μg(動植物樣品),≥ 6μg(人樣品);

3、樣品濃度:≥ 30 ng/μL

4、樣品完整性:主帶清晰,無降解或輕微降解;

5、樣品純度:OD260/280 =1.8~2.0

【案例一】:運用RAD-seq技術對多年生黑麥草的親本和193F1個體進行研究,結果鑒定了三個稈銹病抗性QTL,隨后結合SSRSTS標記構建出了雌雄親本圖譜;
 

【案例二】:利用RAD技術對果蠅進行研究,在一個150kb的區域內精確地定位了一個重組斷點(recombination breakpoint)。

[1]Miller MR, Dunham JP, Amores A, et al. Rapid and cost-effective polymorphism identification and genotyping using restriction site associated DNA (RAD) markers. Genome Research.2007 February; 17(2):240-248;

[2] Pfender WF, Saha MC, Johnson EA, et al. Mapping with RAD (restriction-site associated DNA) markers to rapidly identity QTL for stem rust resistance in Lolium perenne. Theor Appl Genet. 2011 May; 122(8):1467-1480.

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